1 - 22 les fugitifs Michael, Lincoln, Abruzzi, Sucre, C-Note, Tweener, Haywire et T-Bag sont parvenus à s'échapper de Fox River. Seul Primo et Westmoreland ont échoué dans leur tentative de fuite.
Furieux, Pope débarque à l'infirmerie pour avoir des explications et des détails sur l'évasion. Il y trouve Westmoreland gisant inanimé dans l'infirmerie, victime de sa blessure au ventre.
Dans la salle de repos, Bellick est retrouvé par les gardes et est sorti du trou. Furieux, il est bien décidé à mettre la main sur les fuyards et à les punir en conséquence.
A la prison, Pope comprend que la porte de l'infirmerie a été laissée ouverte intentionnellement et interroge la collègue de Sara qui lui révèle l'attirance de la jeune femme pour Scofield.
Pendant qu'ils continuent à essayer d'échapper à la police, les complices d'Abruzzi commencent à s'impatienter.
Ralenti par T-Bag et Michael accrochés l'un à l'autre, Abruzzi se saisi d’une hache et coupe la main de T-Bag pour libérer Michael. A son tour T-Bag est abandonné par ses codétenus qui continuent leur folle escapade.
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Haywire en équilibre sur son vélo, Tweener en route pour Saint Louis, les autres à quelques pas de l'aérodrome.
A l'aérodrome, les complices d'Abruzzi, chargés de les attendre dans le jet, alertés par les sirènes de police, paniquent et prennent la décision de partir sans les évadés.
C’est ainsi que s’achève la première saison, sur nos prisonniers courant dans les champs après avoir raté leur avion..